黄连基因组(Nature Communications)一作刘义飞研究员带来药用植物基因组研究最新进展讲座
中国有1000多种药用植物,因与国人健康息息相关。千种药用植物基因组研究计划旨在3-5年内收集整理并测序完成1000种重要的药用植物基因组,并构建一个全球最大的药用植物基因组数据库,旨在推动药用植物基因组学、次生代谢产物合成生物学及相关分子育种的研究。
千种药用植物基因组数据库访问网址:www.herbgenome.com,目前已收录100+种药用植物基因组数据。
9月9日——9月23日,Oxford Nanopore联手AG代理基因共同推出“药用植物基因组研究最新进展”研讨会专场直播活动。本次研讨会邀请到行业内3位教授及专家,将围绕本草基因组的进展和研究方法、本草基因组完成后研究工作的探讨、基于基因组学的多组学研究等多个方向展开。
主题:黄连基因组揭示了小檗碱多样性
时间:2021年9月9日 15:00
主讲人:刘义飞
主讲人介绍:
刘义飞,湖北中医药大学研究员,博士生导师。主要研究方向为中药资源评价与组学研究,利用基因组学、转录组学、代谢组学等多组学联合的方式,对湖北优势道地药材(如黄连、野菊花)等开展基础和应用基础相关的研究工作。主持或参与国家863计划、国家重点研发计划、国家自然科学基金和中国科学院及地方各类科研项目10多项,发表各类科研论文60余篇,在Nature Communications、Molecular Plant、New Phytologist、Plant Biotechnology Journal等学科顶级期刊以第一或通讯作者发表SCI论文多篇,获国家技术发明专利6项,相关成果获得湖北省、中科院和农业部等省部级科研奖励3项。
报告主要内容:
黄连(Coptis chinensis),毛茛科黄莲属多年生草本植物,为湖北省“一县一品”道地药材,在我国传统中医药中具有悠久的用药历史。黄连具有多种药用价值、且代表了真核早期分化的重要谱系。刘义飞研究团队在Nature Communications首次公开发表了黄连的高质量染色体级别基因组,通过系统发育和比较基因组分析揭示了黄连的系统发育位置,并发现了由毛茛科(Ranunculaceae)共享的一次古老的全基因组复制事件。该研究对小檗碱合成通路基因进行了系统挖掘,发现基因组串联重复导致了毛茛分枝特异性细胞色素CYP719基因家族成员的扩增,并鉴定出一个编码小檗碱生物合成途径中关键CYP719基因的功能多样性,可能在小檗碱相关的其他生物碱多样性中发挥关键作用。该研究提供了早期分化的真双子叶植物基因组图谱,并为毛茛科植物的遗传学和应用研究提供了一个有价值的模式基因组。
王小薇
Oxford Nanopore Technologies大客户经理,常驻上海
厦门大学生物系本科,硕士,上海交大安泰MBA在读,10年分子生物学和高通量测序领域从业经验。先后就职于华大基因,德国QIAGEN等行业知名企业的研发,技术支持和市场部门。
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