Oxford Nanopore 测序平台独特的Ultra-long测序能够产生超长测序片段，轻松跨越基因组中大片段重复区域，能够显著提升物种基因组组装效果，填补基因组中gap，使得T2T（Telomere-to-Telomere）的gap-free基因组组装成为可能。

AG代理基因生产研发部通过改良、优化动植物样品提取流程，实现不切胶、不富集片段，直接测序产出超长片段，最新植物ONT超长案例，测得最长Reads长度达1.766 Mb。

AG代理基因目前已完成多类动、植物样本的ONT超长建库测序，具有丰富的动、植物组织超长DNA提取和ONT Ultra-long建库测序项目经验。

ONT Ultra-long 应用领域：

1.组装T2T物种基因组，克服了着丝粒或高重复区域的组装困难的问题，染色体的连续性和完整性大大提高，有助于对基因组中高重复序列区域或高重复结构进行深入研究。例如，人类完整的8号染色体组装^[1]以及拟南芥T2T近完成图的组装^[2]。

2. 对于已有参考基因组的物种，ONT Ultra-long reads能够有效减少基因组的gap，特别是在人类基因组和拟南芥基因组中已有报道。例如，ONT reads已被用于填补人类参考基因组中的12个gap（每个gap长度>50 kb）^[3]，并且用于组装人类Y染色体的着丝粒区域^[4]。

参考文献：

[1] Eichler E ,  Logsdon G ,  Vollger M , et al. The structure, function, and evolution of a complete human chromosome 8. Nature, 2021.

[2]Wang B, et al. High-quality Arabidopsis thaliana Genome Assembly with Nanopore and HiFi Long Reads. Genomics, Proteomics & Bioinformatics, 2021.

[3] Jain M , et al. Nanopore sequencing and assembly of a human genome with ultra-long reads. Nature Biotechnology, 2018.

[4] Jain, M, et al. Linear assembly of a human centromere on the Y chromosome[J]. Nature Biotechnology, 2018.