2022年10月13日（本周四）14:30，由上海交通大学生命科学技术学院薛泓嶂博士亲授水稻基因组研究秘诀！

报告主题：Genome Research | Long-read sequencing of 111 rice genomes reveals significantly larger pan-genomes

报告摘要：泛基因组是一个群体中所有基因组的集合。基于短测序的3K水稻泛基因组比水稻参考基因组（NipRG）大270 Mb左右。在本文中，我们通过引入一系列新的步骤来处理长测序数据。与NipRG相比，基于长测序的105份水稻泛基因组包含604 Mb的新序列，其中重复序列占主要部分。加上6份野生稻，泛基因组中总共约有879Mb新序列和19000个新基因。此外，我们还为所有具有代表性的水稻群体创建了高质量的参考基因组，包括五个无间隙参考基因组。这项研究让我们对水稻泛基因组的理解更近一步，这种长测序的泛基因组构建方法可以用于广泛的基因组学研究。

个人简介：2018年从同济大学本科毕业后，进入上海交通大学师从韦朝春教授攻读博士学位。主要从事泛基因组学和癌症基因组学的相关研究。以第一作者/共同一作在Genome Research和GigaScience等杂志发表论文3篇。担任Bioinformatics Recipes for Plant Genomics代码评审人。

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