喜讯!AG代理基因获得全国独家“Hyper-seq技术”成果转化实施许可!
2022年12月20日,AG代理基因获得全国独家“Hyper-seq技术”成果转化实施许可。2023年2月9日,海南大学与AG代理基因在第一届国际热带植物学术会议上签署全国独家“Hyper-seq技术”成果转化协议,未来,双方将充分利用人力资源和技术优势,基于“Hyper-seq技术”共同助力大数据育种变革。
Hyperseq做为最新一代简化基因组技术,其建库便捷性、标记密度、样本重复性指标、低成本全面优于现有的分子标记开发技术(芯片、GBS、RAD等),在未来分子育种、核心种质资源开发、全基因组关联分析和物种鉴定等领域具有巨大的应用空间。Hyperseq曾获得全国颠覆性技术创新大赛领域赛获得优秀奖以及第一届“崖州湾杯”科技创新大赛一等奖。
除此之外,聘请夏志强研究员为AG代理基因“植物育种首席科学家”,为广泛应用Hyper-seq测序技术提供指导,加速我司实现高效率大数据育种和群体研究。
Hyper-seq
技术介绍
Hyper-seq是一种极低成本、高效、灵活、高通量的DNA测序文库制备和基因分型方法。该技术具有广泛的适用性和可扩展性,同时具有一定的基因区域富集效应。可以根据不同的物种和项目的需求,通过使用不同的Hyper-seq引物,灵活地调节标记密度,通过特殊的PCR方式,不需要额外酶切和连接接头等,即可实现大量样品同时建库,产出海量基因型大数据,以低成本满足不同物种大规模分型测序的需求,助力实现高效率大数据育种和群体研究。
Hyper-seq技术流程
极简建库:非酶切,PCR完成建库;
极低成本:96或384 barcodes混合建库,降低成本;
应用范围广:灵活调整位点密度,摆脱大基因组、大样本量限制;适用于作物遗传背景筛选、遗传图谱构建、全基因组关联分析、目标关键基因或新候选基因定位、品种鉴定、基因组选择育种、生物安全防控的分子检测等。
Hyper-seq-G:最常规模式;标记覆盖基因组10%,适合于大部分物种进行育种研究;
Hyper-seq-FD:极简模式;标记覆盖基因组0.0024%-4.2%,适合大基因组育种;
Hyper-seq-INC:高密度模式;8对引物提供约60%的基因组覆盖度,适合高密度性状定位研究;
三种模式可供选择
Hyper-seq已为>40家研究机构和高校提供技术服务,用于超50个物种的50000份材料。
通过Hyper-seq技术,在玉米、马铃薯、节节麦、木薯、水稻、小麦中检测到的分子标记数量远远高于利用育种芯片检测出的分子标记数量,而且分子标记具有覆盖均一性等优势。
夏志强研究员简介
夏志强研究员
海南大学三亚南繁研究院“基因组与大数据育种”团队负责人,海南大学热带作物学院副院长,美国加州大学戴维斯分校访问学者,海南省南海青年名家,中国民族医药协会黎药分会理事,热区石漠化山地绿色高效农业科技新联盟理事,博士生导师。从事基因组测序,转录水平、高通量技术开发与大数据育种技术方法等研究。开发多组学平台,提供染色体层面上的复杂基因组、甲基化等大数据分析体系。发表了世界首个木薯、百香果、象草等精细基因组图谱。针对极复杂基因组完成马铃薯同源四倍体单倍型和木兰科单倍型基因组组装。原创研发两代超低成本基因型分型技术和表观遗传分析技术,低成本Hyper-seq测序技术应用广泛。成功用于约50个物种,10000多份样品研究。获授权国家发明专利4项,国际发明专利3项。Nucleic Acids Research、The Innovation、Molecular Ecology Resources、Horticulture Research、Biotechnol Biofuels、Nature Communications等SCI杂志发表,第一或通讯作者26篇,累积影响因子超过100。两项国家重点研发专题负责人,主持参加国家自然科学基金、地区重点基金等科研项目10余项。