AG代理基因云分析平台BenagenCloud:一键操作,轻松搞定转录组全流程分析
网址://www.benagencloud.com/
期待已久,AG代理基因云分析平台BenagenCloud——转录组分析模块正式上线!特惠活动来袭,2023年12月15日起所有做转录组测序分析的客户,均可免费享受价值1999元的AG代理基因云分析平台BenagenCloud分析服务。如有兴趣,请联系当地销售,我们将为您免费开通分析权限。
无需服务器,无需搭建环境,无需写代码,在本地即可轻松完成转录组的全流程分析,还可根据需求选择个性化组合分析,一个网页,轻松玩转转录组数据!
一、
一键分析转录组全流程
BenagenCloud转录组模块可一键选择全部样本,自定义差异分组、Venn图组合和分析参数,一键提交保存即可在我的分析中查看分析结果。
二、
个性化组合分析
BenagenCloud转录组模块还可根据需要选择个性化组合分析,六大块的分析内容可自由选择组合。个性化分析的参数可自定义设置,分析数据可自定义选择,自由调整,轻松完成个性化分析。
主要分析结果展示
格物致知12月14日专场
【主讲人】徐萍 上海辰山植物园/中科院分子植物卓越中心
【报告主题】多组学揭示益母草碱生物合成途径
【发表期刊】Molecular Plant
Q&A
1. 您在前期工作中是如何对益母草生物碱拆解,推测的?
回答:这个过程中有很多对植物化学研究比较深入的老师建议,认为益母草生物碱在酯键断裂是可能性非常高的,在后续的转录、代谢的实验中也验证了这个推测,验证了相关的中间产物;同时,益母草和细叶益母草一个是含有益母草碱,另一个不含有,这个差异也有助于找到对应的中间产物的差异。
2. 从类群角度上来看,细叶不产益母草碱是因为细叶益母草缺失了SCPL12,还是因为益母草多出了SCPL12的功能?
回答:目前没有更多的证据证明益母草和细叶益母草谁更古老;但是,根据和黄芩的比较发现,细叶益母草可能是更古老的物种,所以应该是益母草多了SCPL12;
3. 老师,在看基因有没有扩张的时候是做了什么工作呢?
回答:比较近缘物种相同基因家族是否发生基因家族扩张,需要基于基因组层面进行分析,也就是先进行每个基因组组装和注释,然后对相关基因家族进行鉴定,最后比较不同物种相同基因集在基因的拷贝数、表达量等信息,去评估其扩张情况!