上期介绍了模拟菌群的多平台16S比对结果，本期基于肠道微生物（粪便样本），比较一下Nanopore、Pacbio、Illumina多平台的效果。

各平台数据量情况：ONT-5w reads、PB-3w ccs、Illumina-20w tags（PB扩增子多为5k ccs，Illumina扩增子多为5w tags，本次研发使用的数据量已远超市面常规数据量）。

属水平饱和性（ONT vs PB）

市面上PB-16S常用数据量为5k ccs，图中5k ccs相较于1w ccs而言还未达到数据饱合；而ONT-16S的4w reads相较于5w reads已趋于数据饱合。

种水平注释率（ONT vs NGS vs PB）

基于unclassified类别的相对丰度占比（蓝色区块面积）可知，ONT与PB平台的16S种水平注释率明显优于NGS。

研发所用粪便样本的多平台注释率对比如下：

综上：

1. 基于肠道菌群研究，ONT-16S的种属水平注释率明显高于二代16S；

2. 基于肠道菌群研究，ONT-16S的测序数据量相较于PB-16S而言更接近饱合。