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月刊 | 8月精选项目文章及行业案例解读

 

项目文章

 

文章标题:The RNA helicase UAP56 and the E3 ubiquitin ligase COP1 coordinately regulate alternative splicing to repress photomorphogenesis in Arabidopsis

发表期刊:The Plant Cell

发表时间:2022.8.3

影响因子:12.085

研究内容:

本文证明了UAP56在拟南芥中负调控光发生。UAP56与COP1在体内外均有相互作用。Nanopore转录组测序分析显示,UAP56和COP1共同调节许多基因的表达水平以及许多常见的pri mRNA的剪接。RNA免疫沉淀实验证实UAP56和COP1结合常见的小RNA和靶mRNA。该研究确定了UAP56和COP1在调节植物前体mRNA的AS中的作用和分子机制。

 

文章标题:Resveratrol suppressed microglia activation and promoted functional recovery of traumatic spinal cord via improving intestinal microbiota

发表期刊:Pharmacological Research

发表时间:2022.7.29

影响因子:10.334

研究内容:

本文通过16S微生物多样性研究发现,白藜芦醇通过改善SCI小鼠小肠生物失调,降低LBP含量,提高小肠代谢产物丁酸盐的含量,进而抑制脊髓小胶质细胞活化,促进SCI小鼠运动和感觉功能的恢复。

 

文章标题:Enhancing the Phytoremediation of Heavy Metals by Combining Hyperaccumulator and Heavy Metal-Resistant Plant Growth-Promoting Bacteria

发表期刊:Frontiers in Plant Science

发表时间:2022.6.2

影响因子:6.627

研究内容:

本研究测试了PGP15改善植物生长和减轻植物中Cd胁迫的能力。此外进行PGP15的全基因组比较基因组分析探索HMT-PGPB促进植物生长的分子机制。提高了对HMT-PGPB与植物之间互作的理解,促进了HMT-PGPB在HM 污染土壤的植物修复中的应用。

 

案例解读

 

文章标题:Transcriptome variation in human tissues revealed by long-read sequencing

发表杂志:Nature

发表时间:2022.08.03

影响因子:69.504

研究内容:

该研究提供了迄今为止最大的长reads RNA数据集,使用的材料来自细胞系和人体组织收集的GTEx项目。鉴定了71,735个新的转录本,这比任何其他研究的数目都要高,与发现的大量组织特异性新转录本一致。在高通量质谱蛋白质组数据中新转录本的高验证率的支持下,作者的数据对人类转录本注释做出了重要贡献。

 

文章标题:Biosynthetic potential of the global ocean microbiome

发表期刊:Nature

发表时间:2022.6.22

影响因子:49.962

研究内容:

本文展示了微生物的生物合成潜力及其在全球海洋微生物组中的基因组背景,通过将数据公开来促进未来的研究。研究只有通过重建MAG和SAG才能获得其大部分新的基因组和功能,尤其是在未充分探索的菌群中,这一结论可以指导未来的生物勘探工作。

 

文章标题:The nearly complete assembly of Cercis chinensis genome and Fabaceae phylogenomic studies provide insights into new gene evolution

发表期刊:Plant Communications

发表时间:2022.08.10

影响因子:8.625

研究内容:

本研究获得了紫荆亚科分支Cercis chinensis(紫荆)的基因组组装,对豆科植物系统基因组学的研究起到了重要的促进作用。通过比较基因组研究发现,在蚕豆科植物物种多样化后,许多基因家族具有谱系特异性,在多倍体化的豆科植物谱系中发现了新的基因,为豆科植物新基因的进化模式研究提供了重要的线索,为植物系统基因组研究提供了有价值的资源。

 

文章标题:Drought induces epitranscriptome and proteome changes in stem-differentiating xylem of Populus trichocarpa

发表期刊:plant physiology

发表时间:2022.06

影响因子: 8.005

研究内容:

本研究为毛果杨SDX响应干旱胁迫下的表观转录组和蛋白质组变化提供了一个全面的研究概况,扩展了人类关于干旱胁迫对基因表达转录后影响的理解,为后续抗逆林木遗传材料的培育提供了理论指导。

 

文章标题:Assembly of a pangenome for global cattle reveals missing sequences and novel structural variations, providing new insights into their diversity and evolutionary history

发表期刊:Genome Research

影响因子:9.438

研究内容:

本文鉴定出牛参考基因组之外的83Mb新序列,率先从群体水平构建了牛泛基因组;同时开发基因组结构变异(Structural Variation, SV)分析流程,首次从SV的角度解析了世界牛品种的血统关系,从适应性等多角度全方位检测了不同分类群体的受选择位点和候选基因,填补了SV作为牛育种材料的不足,并解析SV潜在形成机理促进对牛基因组演化的深入理解。

 

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