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CGM第214期-植物独特的转录机制:两种RNA聚合酶高效协作合成双链RNA的转录机制

编者荐语:

由AG代理基因赞助的CGM沙龙,此次为您带来中科院分子植物科学卓越创新中心的黄坤,徐洲的分享。

 

CGM将于北京时间 2022年02月16日 (星期三) 9.PM(美国中部时间02月15日 7.AM)举办214期在线沙龙活动。

 

本期活动,我们邀请到了来自中科院分子植物科学卓越创新中心黄坤,徐洲更带来题为“植物独特的转录机制:两种RNA聚合酶高效协作合成双链RNA的转录机制”的分享。

 

腾讯会议ID: 437-641-378

腾讯会议链接://meeting.tencent.com/dm/PIjJvYgS7qI7

 

嘉宾简介

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黄坤,本科毕业于安徽农业大学园艺学院;现为中科院分子植物科学卓越创新中心张余课题组2018级硕博连读生。

基因组中的遗传信息得以表达,需要RNA聚合酶进行转录。以DNA为模板合成RNA的转录过程不仅是基因表达第一步,还是基因表达的主要调控步骤。因此对RNA聚合酶分子机器结构、运行机理以及调控机制的研究能够回答基因表达精密调控的基础生物学问题。目前所在课题组主要结合生物化学、结构生物学及微生物学等手段围绕单亚基和多亚基RNA聚合酶分子机器为中心,探索转录的调控机制。

 

徐洲更, 本科毕业于浙江农林大学;现为中科院分子植物科学卓越创新中心王佳伟课题组2016级硕博连读生。

目前主要从事的是植物的高通量测序数据的分析,例如2019年作为共同第一作者(第二位)参与拟南芥茎尖单细胞图谱解析工作,2021年作为共同第一作者(第四位)参与了植物RNA聚合酶Pol IV结构解析工作。

除学术工作外,也持续在微信公众号,哔哩哔哩,个人博客站点等平台上发表自己的生物信息学学习心得,包括文字和视频教程。

 

内容摘要

DNA甲基化通过影响基因的表达来维持基因组的稳定性。在植物中,DNA依赖的RNA聚合酶IV(Pol IV)与RNA依赖的RNA聚合酶2(RDR2)协作合成DNA甲基化建立和维持所必需的双链小干扰RNA。我们解析了植物RNA聚合酶Pol IV-RDR2全酶和Pol IV-RDR2转录回溯延伸复合物结构冷冻电镜结构。研究结果展示了真核生物第四个RNA聚合酶的三维结构和首例两种RNA聚合酶(Pol IV和RDR2)形成的复合物的独特构造,并且揭示了Pol IV-RDR2复合物以dsDNA为模板输出dsRNA的特殊转录模式和机制。

 

本讲座徐洲更同学还将进行生物信息学的自学心得体会分享:

徐洲更同学凭借着自己对生信的兴趣,以及导师的鼓励和信任,开始自学生信,并在网络上分享自己的学习心得。在课题组的生信分析项目磨练中,不断成长,并开始指导课题组的其他成员的生信学习。

本次演讲,主要分享自己在生信自学路上的心得体会,供大家参考。

 

参考文献:

Huang K, Wu XX, Fang CL, Xu ZG, Zhang HW, Gao J, Zhou CM, You LL, Gu ZX, Mu WH, Feng Y, Wang JW, Zhang Y. Pol IV and RDR2: A two-RNA-polymerase machine that produces double-stranded RNA. Science. 2021 Dec 24;374(6575):1579-1586. doi: 10.1126/science.abj9184. Epub 2021 Dec 23. PMID: 34941388.

 

关键词:

RNA polymerase, Pol IV, RDR2, RdDM, dsRNA synthesis

 

 

参加方式

 

北京时间: 2022 年 02 月 16 日(星期三)9:00 PM

美中时间: 2022 年 02 月 15 日(星期二)7:00 AM

 

参与平台:Zoom及Youbube直播(关注:CGMonline)

 

加入腾讯会议://meeting.tencent.com/dm/PIjJvYgS7qI7

腾讯会议ID:437-641-378

 

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华人基因组学在线沙龙 (CGM),由几位在北美从事基因组学研究的青年华人学者于 2017 年 1 月份发起。旨在增进从事基因组学研究的华人之间的交流、学习和合作。欢迎从事分子生物学、遗传学、基因组学、生物信息学、生物统计学、进化生物学相关领域的华人同学(包括本、硕、博和博后)和老师参与。论坛每周一次,每次邀请一到两位学者就自己的研究课题进行学术汇报。汇报主要以中文的形式网络直播。

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