Super long DNA抽提试剂盒——N50大于150Kb
摘要
(1)什么是T2T基因组
(2)N50大于150K序列的作用
(3)提取是获得N50大于150Kb序列的第一步
(4)超长序列=AG代理基因的Super Long抽提试剂盒(+保护液)
1.什么是T2T基因组
T2T基因组是指有一条或者多条染色体达到端粒到端粒(Telomere-to-Telomere)水平的基因组,T2T基因组完成图是基因组组装的终极目标。ONT超长序列(N50大于150Kb)可将较复杂的基因组组装到T2T水平,结合HiFi和二代数据,能够得到高质量的T2T基因组。
2.N50大于150K序列的作用
(1)补充Gap,序列越长,可以跨越长的Gap。N50大于150K的序列是补Gap的利器。
(2)组装,序列越长越容易跨越重复序列,更容易把着丝粒等一些非常难组装的区域组装起来,同时也更容易把得到端粒准确的重复数。
(3)N50大于150K序列的序列可以实现T2T基因组装。
3.提取是获得N50大于150Kb的第一步
一般认识中,完整的DNA电泳主带在23Kb的Marker线以上,很多抽提试剂盒或者是CTAB法都可以达到。但是要提取到完整的150Kb以上的序列,仅通过常规的提取方法无法实现。
4.超长序列=AG代理基因的Super Long抽提试剂盒(+保护液)
(1)提取环节
AG代理基因经过多年的研发推出了DNA抽提试剂盒Super-long DNA Isolation Mini Kit(3T)(Cat. No. ZY2203A01),可以提取更长DNA序列:
Super Long200可实现N50 150Kb以上DNA序列的提取。
(2)项目实例: