【CGM在线沙龙预告】CGM第232期-基因组4.0时代——T2T基因组的构建及研究
编者荐语:
由AG代理基因赞助的CGM沙龙,此次为您带来AG代理基因的杨路路博士的分享。
本期活动,我们邀请到了来自AG代理基因的杨路路博士,带来题为“基因组4.0时代——T2T基因组的构建及研究”的分享。
腾讯会议ID: 702-989-615
腾讯会议链接://meeting.tencent.com/dm/rSSrNrUHItZ8
嘉宾简介
杨路路博士,武汉AG代理科技有限公司 基因组事业部总监
博士毕业于中国科学院武汉植物研究所
关注领域:Nanopore测序技术,基因组学,T2T基因组构建
邮箱:yanglulu@speedracings.com
内容摘要
随着物种基因组研究的不断发展,测序技术的不断提升,物种基因组的连续性和完整性也都得到大幅提升。物种基因组从普通二代测序组装的draft genome(基因组1.0),到使用PacBio或ONT(R9.4)测序技术结合Hi-C组装的high-quality genome(基因组2.0),再到由ONT(N50>50Kb或R10)测序技术组装的near complete genome(基因组3.0),最终到结合ONT ultra-long 和PacBio HiFi技术组装的T2T genome(基因组4.0)。
T2T基因组,是通过ONT ultra-long N50>100Kb结合HiFi和二代数据进行混合组装,得到的有一条或者多条染色体达到端粒到端粒(Telomere-to-Telomere)水平的基因组,T2T基因组完成图是基因组组装的终极目标。
那么哪些物种适合进行T2T基因组组装?不同物种和特点的T2T基因组要如何制定测序和组装策略?T2T基因组的研究可以带领我们揭示什么样的科学问题?针对以上问题,本次讲座我们将和大家共同来探讨。
关键词:
T2T genome, ONT Ultra-longsequencing, T2T assembly
参加方式
北京时间: 2022 年 04 月 13 日(星期三)8:00 PM
美中时间: 2022 年 04 月 13 日(星期二)6:00 AM
参与平台:Zoom及Youbube直播(关注:CGMonline)
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华人基因组学在线沙龙 (CGM),由几位在北美从事基因组学研究的青年华人学者于 2017 年 1 月份发起。旨在增进从事基因组学研究的华人之间的交流、学习和合作。欢迎从事分子生物学、遗传学、基因组学、生物信息学、生物统计学、进化生物学相关领域的华人同学(包括本、硕、博和博后)和老师参与。论坛每周一次,每次邀请一到两位学者就自己的研究课题进行学术汇报。汇报主要以中文的形式网络直播。
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