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【CGM在线沙龙预告】CGM第230期：孟德尔随机化应用于微生物组、代谢组和疾病的因果研究
编者荐语：
由AG代理基因赞助的CGM沙龙，此次为您带来覃友文博士、刘小敏博士的分享。
CGM将于北京时间 04 月 07 日 星期四 10AM举办在线沙龙活动。本期活动，我们邀请到了覃友文博士、刘小敏博士来给我们带来关于“孟德尔随机化应用于微生物组、代谢组和疾病的因果研究”的主题演讲，演讲题目分别为"大人群GWAS揭示人遗传变异和饮食对肠道微生物和疾病的影响"和“肠道菌群和血液代谢物的因果关联研究”，敬请期待！
嘉宾简介
刘小敏，2011年加入华大基因，目前主要研究方向是通过对基因组、宏基因组和代谢组等多个层面的组学数据进行分析和整合，探索宿主基因组和多部位菌群以及代谢物的关联机制和因果关系，以及重大疾病发生发展的分子机理。目前已发表 SCI 文章 18 篇，其中以一作或通讯作者发表文章 10 篇，涉及 Nature Genetics, Nature communication，Aging Cell，Cell Discovery，JAMA networkopen 等杂志。已授权的发明专利 3 项。参与多项国家⾃然科学基⾦、深圳市科学创新委员会等科技项⽬。
内容摘要
如何有效干预从一开始就是肠道菌群研究的核心问题之一，而随机临床试验仍是一条漫长的道路，孟德尔随机化研究这一天然过程在因果理论研究中则有独特的优势。本研究通过构建基因组与肠道菌群的关联、基因组与血液代谢物关联，发现多项可能具有应用前景的肠道菌群与血液指标的作用，为未来的靶向菌群的精准干预奠定基础。
参考文献：
Liu, Xiaomin; Tong, Xin; et al ; Mendelian randomization analyses support causal relationships between blood metabolites and the gut microbiome, Nature Genetics, 2022, 54: 52-61
嘉宾简介
覃友文，墨尔本大学基因组学PhD，香港大学生物统计MPhil。自2010年，长期从事人体微生物组研究，主要关注人肠道微生物菌群。参与了第一波人肠道微生物菌群与疾病的关联性研究，发现多个与疾病有关联的微生物特征。博士期间，通过研究宿主遗传变异，发现和验证了与肠道微生物组成相关联的基因变异，包括LCT、ABO和MED13L等基因位点；并且利用遗传信息，发现对疾病有潜在致病作用的细菌，如Morganella可能促进抑郁症的发生。同时还通过高通量质谱测序，研究肠道微生物与人体血液代谢物的关系，探究宿主和微生物的互作。目前就职于深圳华大生命科学研究院，开展人体微生物在癌症早筛和干预上的研究和应用。
内容摘要
人肠道微生物与人体健康紧密关联，其组成受宿主和环境因素影响。为研究人遗传变异和其他因素对肠道微生物的影响，我们聚焦于约6000芬兰人组成的群体，采集他们的遗传变异信息、肠道微生物组、饮食情况和健康档案（长达16年的记录）。通过GWAS，我们发现567个独立的SNP-Taxon关联。最为突出的是，编码乳糖酶的LCT基因座与双歧杆菌（Bifidobacterium）的关联，并且该关联受个体的奶制品摄入量影响。另一个重要关联是关于ABO基因座与乳粪球菌（Faecalicatena lactaris），揭示人体ABO血型和肠道微生物的潜在关系【链接1】。我们的发现还指向肠脑轴的关联。在孟德尔随机化（Mendelian randomization）分析中，摩根氏菌属（Morganella）能增加重度抑郁症的发病率，这个关系与16年的随访数据研究相吻合【链接2】。综上，我们的研究揭示了宿主和微生物之间复杂而有趣的关系，并且为疾病研究提供新思路。
链接：
1. ABO血型和肠道微生物的关联解读：//mp.weixin.qq.com/s/OkgBPuEWTSBpY5eI0GgYQw
2. 脑肠轴新发现解读：//mp.weixin.qq.com/s/pdE6V8waUIBMJZxBRFwYGA
参考文献：
Qin Y, Havulinna AS, Liu Y, Jousilahti P, Ritchie SC, Tokolyi A, Sanders JG, Valsta L, Brożyńska M, Zhu Q, Tripathi A, Vázquez-Baeza Y, Loomba R, Cheng S, Jain M, Niiranen T, Lahti L, Knight R, Salomaa V, Inouye M, Méric G. Combined effects of host genetics and diet on human gut microbiota and incident disease in a single population cohort. Nat Genet. 2022 Feb;54(2):134-142. doi: 10.1038/s41588-021-00991-z.
参加方式
时间：2022 年 04 月 07 日 星期四 10AM（北京时间）
参与平台：Zoom及Youbube直播（关注：CGMonline）
Zoom会议链接: //us06web.zoom.us/j/87870509801?pwd=SGpvdEc3YVRQL2twTmJyenhnTDFrZz09 （可点击阅读原文/Read more直接进入）
Zoom会议ID：878 7050 9801 密码：207409
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