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CGM第252期:QTN、QTN×环境互作和QTN×QTN互作检测的统一的压缩方差组分混合模型关联分析方法

编者荐语:

 

由AG代理基因赞助的CGM沙龙,此次为您带来华中农业大学章元明博士的分享。
 

以下文章来源于CGM基因组沙龙 ,作者CGM

CGM将于北京时间 2022年06月08日 (星期三) 8.PM(美国中部时间06月08日 7.AM;欧中时间0608 2.PM举办252期在线沙龙活动。

 

本期活动,我们邀请到了来自华中农业大学章元明博士带来题为“QTN、QTN×环境互作和QTN×QTN互作检测的统一的压缩方差组分混合模型关联分析方法”的分享。

 

腾讯会议ID: 177-839-812

腾讯会议链接://meeting.tencent.com/dm/uM4omsnjnFIh

 

 

嘉宾简介

 

 

章元明是华中农业大学植物科技学院二级教授,加州大学河滨分校博士后,中国农业生物技术学会理事,入选教育部新世纪人才等部省级人才计划3项。长期从事数量遗传学、基因分子进化和大豆遗传学研究工作,主要进展有:建立和发展了关联分析的混合模型方法;探索了基因组变异与物种特有性状形成的分子进化机制;提出了QTL定位和集团分离分析的连锁、小效应和极端超显性基因的检测方法;系统拓展了主基因+多基因混合遗传分析方法;开展了大豆驯化性状遗传基础研究。主持与参加科研项目20余项,发表论文150余篇,其中SCI论文93篇。获教育部自然科学二等奖1项。担任Heredity等刊物副主编和BMC Genomics等刊物编委。已培养各类研究生60余名。获2020年度学校教书育人奖和教育成果特等奖(排第3位)。主编的《生物统计学》获全国农业教育优秀教材奖。

内容摘要

 

本讲座将分享一个QTN、QTN×环境互作和QTN×QTN互作检测的统一的压缩方差组分混合模型关联分析方法3VmrMLM。

章元明教授团队的博士研究生李梅和博士后张亚雯是论文的共同第一作者。

更详细内容请见科学网报道“新方法可实现多环境数据的全基因组关联分析”:

//paper.sciencenet.cn/htmlpaper/2022/2/20222281475450370478.shtm;

和南湖新闻介绍“我校章元明教授团队在关联分析方法学研究中取得突破性进展”:

//news.hzau.edu.cn/2022/0224/62647.shtml

 

 

参考文献:

A compressed variance component mixed model for detecting QTNs and QTN-by-environment and QTN-by-QTN interactions in genome-wide association studies. Molecular Plant, 2022, //www.cell.com/molecular-plant/fulltext/S1674-2052(22)00060-0

 

 

关键词:

QTN,QTN-by-environment interaction, QTN-by-QYN interaction, mixed model, genome-wide association studies,rice

参加方式

 

北京时间: 2022 年 06 月 08 日(星期三)8:00 PM

美中时间: 2022 年 06 月 08 日(星期三)7:00 AM

欧中时间: 2022 年 06 月 08 日(星期三200 PM

 

参与平台:Zoom及Youbube直播(关注:CGMonline)

 

加入腾讯会议://meeting.tencent.com/dm/uM4omsnjnFIh

腾讯会议ID:177-839-812

 

 

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华人基因组学在线沙龙 (CGM),由几位在北美从事基因组学研究的青年华人学者于 2017 年 1 月份发起。旨在增进从事基因组学研究的华人之间的交流、学习和合作。欢迎从事分子生物学、遗传学、基因组学、生物信息学、生物统计学、进化生物学相关领域的华人同学(包括本、硕、博和博后)和老师参与。论坛每周一次,每次邀请一到两位学者就自己的研究课题进行学术汇报。汇报主要以中文的形式网络直播。


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