文章标题：Integrated multi-omics analysis and microbial recombinant protein system reveal hydroxylation and glycosylation  involving nevadensin biosynthesis in Lysionotus pauciforus

发表期刊：Microbial Cell Factories

发表时间：2022.09.19

影响因子：6.352

研究内容：代谢组学和全长转录组关联分析揭示了岩溶适应植物吊石苣苔次生代谢产物的积累模式和生物合成途径。此外，两个LpCYP82D成员和一个LpUGT的功能鉴定重建了石吊兰素的生物合成途径。AG代理基因承担了该研究中PacBio 3+2全长转录组和广泛靶向代谢组的检测和分析工作。

文章标题：Application of a novel lytic phage vB_EcoM_SQ17 for the biocontrol of Enterohemorrhagic Escherichia coli O157:H7 and Enterotoxigenic E. coli in food matrices

发表期刊：Frontiers in microbiology

发表时间：2022.08.05

影响因子：6.064

研究内容：基因组分析表明SQ17噬菌体不具有抗生素抗性、毒素、溶原性或毒力因子相关基因，是潜在食品应用的绝佳候选者。SQ17具有广泛的宿主范围，能够感染 EHEC O157:H7、ETEC 和其他大肠杆菌菌株。研究表明噬菌体SQ17应用于减少新鲜生菜中的 EHEC O157:H7 和 ETEC 污染，并且SQ17具有高感染能力和快速复制率更适合应用于食品工业。较高温度（25℃）会影响噬菌体的杀菌效果，因此，不建议在食品工业中长时间在高温下储存或加工新鲜食品。AG代理基因承担了该研究中的噬菌体基因组测序组装及部分分析工作。

文章标题：A genome and gene catalog of glacier microbiomes

发表期刊：Nature Biotechnology

发表时间：2022.06.27

影响因子：68.164

研究内容：本研究得到的西藏冰川基因组和基因（TG2G）目录包括883个基因组和2358个宏基因组组装基因组（MAG），对应30个门的968个物种。还包含超过2500万个非冗余蛋白编码基因，对加深西藏冰川微生物组的结构和功能研究十分有帮助。

文章题目：Human infection with avian-origin H5N6 influenza a virus after exposure to slaughtered poultry

发表期刊：Emerging Microbes & Infections

发表时间：2022.03.12

影响因子：19.6

研究内容：该研究报告了中国东南部浙江省首例人感染H5N6禽流感病毒的病例。研究者快速表征患者和相关环境H5N6甲型流感变异株基因组，这些病毒变异株来自禽类，并在感染后适应于人类宿主。H5N6基因组的比较分析表明，相关环境和家禽市场的病毒污染情况复杂，在7个基因组中发现了3个不同的变异。考虑到这例H5N6感染病例，必须提高对接触受感染屠宰家禽或相关环境中可能的病毒变异风险的认识。

文章题目：The genome of homosporous maidenhair fern sheds light on the euphyllophyte evolution and defences

发表期刊：Nature Plants

发表时间：2022.09.01

影响因子：17.352

研究内容：系统发育位置和其同孢性质使铁线蕨基因组成为一个有价值的参考，有助于揭示关键的进化事件，包括同孢囊发育和突出的病原体抗性。该研究根据同孢囊的遗传基础进行推断，揭示了同型孢子发育过程与异型孢子花粉的相似性。作为代表同型孢子蕨类的模式物种，铁线蕨的高质量基因组为研究现存蕨类的起源以及基因家族进化等相关的一系列特征提供了有意义的模型。