1.一篇Nature文章数据引起的怀疑

2022年08发表在Nature的一篇文章报道：鉴定到人的70000个新转录本数据集，又又又使用质谱里面鉴定到了7000多个新的蛋白质（Transcriptome variation in human tissues revealed by long-read sequencing）。看着数字，作为稳坐多年的海王，Protein Α开始怀疑人生了。

2.这是一个古老的故事

这是一个非常非常非常古老的故事，大抵是月老还没有诞生的岁月，但是具体时间谁知道呢，应该是生命开始诞生的时候就已经开始发生了。又有谁会关注呢，反正是一个永远纠结不清的故事，但是又每时每刻都在发生。有很多很多人想弄清楚事情的始末，这是一个持续了很久的大事件。

在很久很久以前，有一个叫Gene的雌雄同体的怪兽，有了很多叫RNA的孩子，这些孩子长得非常相似，这些孩子里面有3个有着一串长长的尾巴和戴着漂亮帽子的叫做mRNA的小姐姐（分别叫Isoform 1，Isoform 2和Isoform 3，话说这名字也太随意了）。故事就从这里开始了。姐妹几个一起在蛋白的王国寻找自己的如意郎君。

3.不靠谱的质谱婚介所，居然给三姐妹找了同一个男友

首先他们找到一个叫质谱的婚介中心，通过质谱拍的照片和生辰八字的计算找到自己的蛋白，准备度过美好的一生。首先质谱仪找到Gene里面的CDS信息，然后拿着非常非常多的叫做谱图照片和CDS去比较，给Isoform 1，Isoform 2和Isoform 3找到了一个如意郎君Protein Α。三姐妹非常高兴，他们分别和男友交往了很长时间，才发现是同一个男友，和Isoform 1的匹配度最高。

4.委屈的海王

Protein Α打上海王的标签以后，失恋了，突然发现女朋友不见了。他疑惑了，开始自言自语：“明明和自己谈恋爱的是一个人，是基因的孩子，一个身份证，怎么突然变成了3个女孩子呢。“有一个古老的先知说我有很多兄弟，是暗物质也没有户口，可是家族的身份证只能找质谱认证，这该怎么办呢。”每一个寂寞的夜晚Protein Α都在发呆，对自己说：“我不是海王”。

5.Gene, Isoform姐妹和Protein Α在质谱婚介所的第一次家长会

一年一度的情人节到了，Gene, Isoform姐妹和Protein Α在质谱婚介所再一次相遇。Isoform 1，Isoform 2和Isoform 3指着Protein Α大声说：“你个海王”。Protein Α哭了，“我不是海王，我们是不是有什么误会，我和我谈恋爱的人只有一个身份证，为什么是3个人呢。”场面一度陷入了混乱。

6.Nature证明Protein Α不是海王

太史令曰：“一个基因通过可变剪接产生多个转录本，其中很多转录本可以编码蛋白，因此一个基因不是对应一个蛋白，一个转录本才对应一个蛋白，有多篇参考文献了”。参考文献如下（关注AG代理基因的公众号有文献解读喔）：

Glinos, D.A., Garborcauskas, G., Hoffman, P. et al. Transcriptome variation in human tissues revealed by long-read sequencing. Nature (2022). //doi.org/10.1038/s41586-022-05035-y

Miller, R.M., Jordan, B.T., Mehlferber, M.M. et al. Enhanced protein isoform characterization through long-read proteogenomics. Genome Biol 23, 69 (2022). //doi.org/10.1186/s13059-022-02624-y

Oka Miho,Xu Liu,Suzuki Toshihiro et al. Aberrant splicing isoforms detected by full-length transcriptome sequencing as transcripts of potential neoantigens in non-small cell lung cancer.Genome Biol, 2021, 22: 9.

7.Protein兄弟和Isoform姐妹的幸福生活

太史令给Isoform每人一个身份证，把他们的CDS信息送到了质谱婚介所，质谱婚介所在几百万张照片里面找了Isoform 1的男友Protein A；Isoform 2的男友Protein B；Isoform 3的男友Protein C。从此他们过上了幸福的生活。

8.多年以后

多年以后Protein A被泛素纠结后走到了生命的尽头，看着自己的身体开始回忆自己的一生。Protein A一直以为是自己在和Isoform姐妹谈恋爱，实际上是他们三兄弟和Isoform姐妹一直在纠缠不清。很长时间，都在埋怨质谱婚介所，实际上是太史令没有给身份证。“怪太史令吗？”又开始自言自语了“我存在的时候还没有太史令呢，其实没有身份糊里糊涂走完一生也挺好，太史令无聊的时候喜欢曰，曰个鬼呀。知识真是令人苦恼的东西，哎呀脑壳疼。”想想Isoform 1生活的那些年，又想想Isoform 1在RNA水解酶那儿走得是那么安详，带走微笑离开了这个世界。Protein A再一次笑了，微笑着走完了一生。

9.太史令曰

太史令曰：“人类对基因、RNA到蛋白质是认识是一个漫长的过程。一开始我们认为一个基因产生一个转录本，编码一个蛋白质。后来发现一个基因可以编码转录多个转录本，产生多个蛋白。”

10.小编说：“太史令别曰了，中心法则开始出现的时候太史令这个官职已经没有了，还曰撒呀”。关注AG代理基因公众号，有您想了解转录本和蛋白的关系的很多软文。